More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1110 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1110  Serine O-acetyltransferase  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.749928  normal  0.160991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1149  Serine O-acetyltransferase  99.45 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268491  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4303  Serine O-acetyltransferase  95.05 
 
 		 234 aa  361  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4324  Serine O-acetyltransferase  69.78 
 
 		 234 aa  269  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2024  Serine O-acetyltransferase  46.24 
 
 		 333 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  46.99 
 
 		 260 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  45.61 
 
 		 258 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  45.03 
 
 		 258 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  43.2 
 
 		 275 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  42.69 
 
 		 258 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1120  serine O-acetyltransferase  44.44 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1670  serine O-acetyltransferase  45.62 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.390403  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_002936  DET1588  serine O-acetyltransferase  42.54 
 
 		 230 aa  124  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  41.52 
 
 		 242 aa  124  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  43.27 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  41.42 
 
 		 280 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4614  Serine O-acetyltransferase  43.86 
 
 		 258 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2311  serine O-acetyltransferase  43.79 
 
 		 274 aa  121  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463939  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  40.35 
 
 		 221 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  41.52 
 
 		 228 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0673  serine O-acetyltransferase  43.2 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0541501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  41.52 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  44.97 
 
 		 258 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  42.11 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3291  serine O-acetyltransferase  42.01 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  42.07 
 
 		 239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  40.83 
 
 		 280 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0177  serine O-acetyltransferase  40.24 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.635275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1162  O-acetylserine synthase  43.2 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.973633  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  42.01 
 
 		 257 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  44.38 
 
 		 261 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1472  serine O-acetyltransferase  43.29 
 
 		 230 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000445007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  41.94 
 
 		 258 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  41.42 
 
 		 263 aa  118  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2254  serine O-acetyltransferase  42.41 
 
 		 234 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000404898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  41.42 
 
 		 263 aa  118  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0402  serine O-acetyltransferase  44.03 
 
 		 229 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000226719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  41.52 
 
 		 240 aa  117  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  42.11 
 
 		 261 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  40.94 
 
 		 222 aa  117  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  43.12 
 
 		 253 aa  117  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2610  serine O-acetyltransferase  44.83 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  39.63 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  39.63 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  38.69 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  44.38 
 
 		 261 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  44.38 
 
 		 261 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1957  serine O-acetyltransferase  40.94 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2614  serine O-acetyltransferase  41.52 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000169029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  40.12 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1336  serine O-acetyltransferase  42.05 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0260631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  44.38 
 
 		 261 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  43.2 
 
 		 255 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  41.62 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2839  Serine O-acetyltransferase  43.2 
 
 		 256 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1117  Serine O-acetyltransferase  42.01 
 
 		 247 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  43.79 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  40.96 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1947  Serine O-acetyltransferase  43.79 
 
 		 249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0360289  normal  0.182379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  43.79 
 
 		 261 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  43.29 
 
 		 273 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40420  Serine O-acetyltransferase  43.2 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1321  serine O-acetyltransferase  40.96 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3579  serine O-acetyltransferase  42.11 
 
 		 286 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277445  normal  0.0674688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0870  Serine O-acetyltransferase  40.94 
 
 		 225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.504104  normal  0.0275303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1382  serine O-acetyltransferase  42.01 
 
 		 259 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0271365  normal  0.022365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  41.42 
 
 		 262 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  40.83 
 
 		 265 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  39.77 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  39.77 
 
 		 224 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  42.69 
 
 		 264 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3325  serine O-acetyltransferase  41.07 
 
 		 243 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  40.85 
 
 		 273 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  41.88 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1668  Serine O-acetyltransferase  40.35 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.310875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0852  serine O-acetyltransferase  39.64 
 
 		 252 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  41.88 
 
 		 241 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  38.92 
 
 		 248 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  40.85 
 
 		 273 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  42.69 
 
 		 249 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  40.85 
 
 		 273 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  40.85 
 
 		 273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  42.33 
 
 		 273 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  40.85 
 
 		 273 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4306  serine O-acetyltransferase  44.3 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01521  Serine acetyltransferase  42.07 
 
 		 247 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2196  serine O-acetyltransferase  43.12 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000019426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12330  serine O-acetyltransferase  43.56 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.369059  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0951  serine O-acetyltransferase  43.83 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2211  serine O-acetyltransferase  42.77 
 
 		 327 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4258  serine O-acetyltransferase  40.24 
 
 		 260 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1767  serine O-acetyltransferase  42.14 
 
 		 255 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  38.6 
 
 		 323 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1389  serine O-acetyltransferase  41.36 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.716666  normal  0.0958041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3747  serine O-acetyltransferase  43.02 
 
 		 169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1220  serine O-acetyltransferase  42.6 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0840  serine O-acetyltransferase  40.38 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2447  serine O-acetyltransferase  42.5 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0083  serine O-acetyltransferase  39.18 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00127612  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1180  serine O-acetyltransferase  45.4 
 
 		 303 aa  111  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>