More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1149 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1149  Serine O-acetyltransferase  100 
 
 
234 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268491  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4303  Serine O-acetyltransferase  94.85 
 
 
234 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1110  Serine O-acetyltransferase  99.45 
 
 
183 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.749928  normal  0.160991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4324  Serine O-acetyltransferase  67.38 
 
 
234 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2024  Serine O-acetyltransferase  45.71 
 
 
333 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  46.47 
 
 
260 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  45.71 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  45.14 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  43.11 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  45.86 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1120  serine O-acetyltransferase  44.38 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1588  serine O-acetyltransferase  44.51 
 
 
230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  41.14 
 
 
240 aa  125  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0673  serine O-acetyltransferase  44.12 
 
 
182 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0541501  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  42.68 
 
 
242 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1670  serine O-acetyltransferase  45.62 
 
 
194 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.390403  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  41.42 
 
 
280 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  43.2 
 
 
268 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1162  O-acetylserine synthase  43.1 
 
 
268 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.973633  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4614  Serine O-acetyltransferase  43.79 
 
 
258 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103477  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  41.46 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  44.91 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  42.68 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2311  serine O-acetyltransferase  43.71 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463939  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  42.07 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  43.03 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3291  serine O-acetyltransferase  42.94 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1472  serine O-acetyltransferase  43.29 
 
 
230 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000445007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3579  serine O-acetyltransferase  40.53 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277445  normal  0.0674688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2254  serine O-acetyltransferase  40.96 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000404898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  40.46 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0402  serine O-acetyltransferase  44.03 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000226719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  45.22 
 
 
261 aa  118  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  42.94 
 
 
257 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0177  serine O-acetyltransferase  41.36 
 
 
227 aa  119  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.635275  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  42.68 
 
 
240 aa  118  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  42.33 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  42.33 
 
 
263 aa  118  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  43.12 
 
 
253 aa  118  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1336  serine O-acetyltransferase  42.07 
 
 
230 aa  118  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0260631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2610  serine O-acetyltransferase  44.83 
 
 
191 aa  118  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  38.69 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  41.85 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  39.63 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4306  serine O-acetyltransferase  40.72 
 
 
202 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  39.63 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  44.31 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  38.02 
 
 
309 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  42.29 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  41.82 
 
 
222 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  44.31 
 
 
261 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  40.57 
 
 
273 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1947  Serine O-acetyltransferase  45.06 
 
 
249 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0360289  normal  0.182379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  44.58 
 
 
252 aa  116  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  44.44 
 
 
255 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  43.2 
 
 
273 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  44.31 
 
 
261 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1180  serine O-acetyltransferase  43.86 
 
 
303 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  44.31 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1117  Serine O-acetyltransferase  43.21 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  40.57 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  40.57 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2839  Serine O-acetyltransferase  44.44 
 
 
256 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700144  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  40.57 
 
 
273 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  42.77 
 
 
230 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2614  serine O-acetyltransferase  41.67 
 
 
233 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000169029  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1957  serine O-acetyltransferase  41.46 
 
 
170 aa  115  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3325  serine O-acetyltransferase  41.07 
 
 
243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  40.57 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1210  serine O-acetyltransferase  43.86 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  43.71 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  43.64 
 
 
249 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  40.85 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  41.36 
 
 
194 aa  114  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  42.59 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1668  Serine O-acetyltransferase  41.21 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.310875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40420  Serine O-acetyltransferase  43.11 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0870  Serine O-acetyltransferase  41.57 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.504104  normal  0.0275303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  40.85 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2211  serine O-acetyltransferase  41.62 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1382  serine O-acetyltransferase  42.94 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0271365  normal  0.022365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0852  serine O-acetyltransferase  40.99 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  42.14 
 
 
169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  40.74 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  43.64 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  41.14 
 
 
273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  40.94 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  41.88 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2388  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000558111  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  40.72 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  39.38 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1321  serine O-acetyltransferase  42.14 
 
 
169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0951  serine O-acetyltransferase  43.83 
 
 
191 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1767  serine O-acetyltransferase  42.14 
 
 
255 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2196  serine O-acetyltransferase  43.12 
 
 
214 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000019426 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01521  Serine acetyltransferase  42.07 
 
 
247 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  40.24 
 
 
323 aa  113  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>