More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1439 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1439  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  100 
 
 
283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0466513  hitchhiker  0.00117562 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.48 
 
 
324 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  30.58 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  31.12 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  33.88 
 
 
431 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  29.35 
 
 
333 aa  86.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  26.88 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.28 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  29.67 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  28.87 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.35 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.52 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  31.32 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.68 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.19 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  28.23 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.2 
 
 
412 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.88 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  28.83 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.24 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  28.83 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  28.83 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.39 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  28.24 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  28.24 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.75 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.74 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.65 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  29.94 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  35.29 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  28.76 
 
 
420 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.46 
 
 
1094 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  34.67 
 
 
644 aa  72  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  26.64 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  27.9 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  28.12 
 
 
471 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  27.84 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.71 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  30.23 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.99 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.56 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.58 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.45 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  29.71 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  27.07 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  28.51 
 
 
317 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  25.38 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  34.62 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  32.37 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  27.57 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  27.21 
 
 
408 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  30.68 
 
 
412 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  27.57 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  28.32 
 
 
329 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  30.28 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  31.29 
 
 
334 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  37.69 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  30.28 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  30.28 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.54 
 
 
360 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.79 
 
 
324 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  30.97 
 
 
334 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.67 
 
 
288 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.96 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.3 
 
 
409 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.91 
 
 
407 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  25 
 
 
324 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.91 
 
 
407 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  37.8 
 
 
311 aa  62  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  30.28 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  31.65 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0292  esterase/lipase-like protein  24.44 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0097365  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  29.88 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  29.88 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  36.29 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.96 
 
 
407 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.63 
 
 
333 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  26.64 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.25 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  38.1 
 
 
376 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  29.36 
 
 
269 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  26.48 
 
 
347 aa  58.9  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  26.64 
 
 
322 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  26.75 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.71 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.75 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  27.9 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  24.73 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.97 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  30.16 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  22.91 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.29 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.97 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.97 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1444  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.14 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.290312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.67 
 
 
645 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.43 
 
 
322 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5283  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.65 
 
 
340 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966169  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.69 
 
 
290 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>