28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1432 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1117    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  30.91 
 
 
554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0936  hypothetical protein  26.16 
 
 
479 aa  117  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.246203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0865  hypothetical protein  24.23 
 
 
510 aa  94.4  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0793  hypothetical protein  25.46 
 
 
519 aa  87  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.380387  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1048  hypothetical protein  26.82 
 
 
506 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0549773  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  22.39 
 
 
575 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0724  hypothetical protein  27.04 
 
 
506 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314117  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0650  hypothetical protein  26.39 
 
 
506 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1899  hypothetical protein  22.48 
 
 
494 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  20.24 
 
 
602 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  24.8 
 
 
595 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2029  hypothetical protein  21.07 
 
 
587 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2095  hypothetical protein  20.85 
 
 
617 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  22.55 
 
 
636 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  22.55 
 
 
636 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  22.55 
 
 
636 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  21.28 
 
 
616 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  21.28 
 
 
616 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  22.13 
 
 
636 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  25.05 
 
 
490 aa  67  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2092  hypothetical protein  22.13 
 
 
617 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2159  hypothetical protein  23.66 
 
 
616 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.428916  normal  0.364676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2107  hypothetical protein  24.47 
 
 
667 aa  57.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  25.18 
 
 
770 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1457  hydrogenase maturation protein HypF  22.55 
 
 
719 aa  47  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  23.11 
 
 
777 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  24.26 
 
 
764 aa  45.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>