20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2408 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2095  hypothetical protein  73.62 
 
 
617 aa  968    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  74.02 
 
 
616 aa  971    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2159  hypothetical protein  73.78 
 
 
616 aa  947    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.428916  normal  0.364676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  73.82 
 
 
616 aa  949    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1313    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  96.54 
 
 
636 aa  1272    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2092  hypothetical protein  78.63 
 
 
617 aa  998    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  96.07 
 
 
636 aa  1264    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  98.27 
 
 
636 aa  1292    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  50.55 
 
 
575 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  49.84 
 
 
595 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2029  hypothetical protein  45.62 
 
 
587 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2107  hypothetical protein  42.58 
 
 
667 aa  502  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  38.98 
 
 
602 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  25.55 
 
 
554 aa  76.6  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  22.13 
 
 
556 aa  67.8  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0865  hypothetical protein  24.4 
 
 
510 aa  48.5  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  26.15 
 
 
490 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0936  hypothetical protein  23.58 
 
 
479 aa  45.4  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.246203  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1899  hypothetical protein  25.93 
 
 
494 aa  44.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>