20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1885 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2095  hypothetical protein  74.13 
 
 
617 aa  971    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  74.49 
 
 
616 aa  972    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2159  hypothetical protein  74.41 
 
 
616 aa  950    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.428916  normal  0.364676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  73.98 
 
 
616 aa  951    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  96.54 
 
 
636 aa  1272    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1309    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2092  hypothetical protein  79.1 
 
 
617 aa  999    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  96.7 
 
 
636 aa  1272    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  97.8 
 
 
636 aa  1286    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  51.82 
 
 
575 aa  618  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  49.69 
 
 
595 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2029  hypothetical protein  45.47 
 
 
587 aa  545  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2107  hypothetical protein  42.54 
 
 
667 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  39.29 
 
 
602 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  25.55 
 
 
554 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  22.55 
 
 
556 aa  68.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0865  hypothetical protein  24.88 
 
 
510 aa  47.8  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  28.46 
 
 
490 aa  47  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1899  hypothetical protein  28.15 
 
 
494 aa  46.2  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0936  hypothetical protein  22.76 
 
 
479 aa  43.9  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.246203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>