19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1818 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2095  hypothetical protein  82.36 
 
 		 617 aa  1039    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1273    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2159  hypothetical protein  97.24 
 
 		 616 aa  1223    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.428916  normal  0.364676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  97.56 
 
 		 616 aa  1224    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  74.49 
 
 		 636 aa  972    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2092  hypothetical protein  74.2 
 
 		 617 aa  921    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  75.12 
 
 		 636 aa  976    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  74.02 
 
 		 636 aa  971    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  74.96 
 
 		 636 aa  980    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  51.37 
 
 		 595 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  52.77 
 
 		 575 aa  621  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2029  hypothetical protein  45.66 
 
 		 587 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2107  hypothetical protein  42.96 
 
 		 667 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  40.87 
 
 		 602 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  21.28 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  23.35 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  25.38 
 
 		 490 aa  44.3  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1899  hypothetical protein  26.28 
 
 		 494 aa  43.9  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0865  hypothetical protein  25.23 
 
 		 510 aa  43.5  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>