19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2159 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2095  hypothetical protein  81.39 
 
 
617 aa  1028    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  97.24 
 
 
616 aa  1244    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2159  hypothetical protein  100 
 
 
616 aa  1273    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.428916  normal  0.364676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  97.08 
 
 
616 aa  1217    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  74.41 
 
 
636 aa  969    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2092  hypothetical protein  73.95 
 
 
617 aa  914    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  75.04 
 
 
636 aa  972    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  73.78 
 
 
636 aa  968    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  74.57 
 
 
636 aa  976    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  51.21 
 
 
595 aa  618  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  51.71 
 
 
575 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2029  hypothetical protein  44.03 
 
 
587 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2107  hypothetical protein  43.11 
 
 
667 aa  521  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  40.48 
 
 
602 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  23.35 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  23.66 
 
 
556 aa  65.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  25.38 
 
 
490 aa  45.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1899  hypothetical protein  26.28 
 
 
494 aa  44.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0865  hypothetical protein  25.23 
 
 
510 aa  44.7  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>