24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1102 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  100 
 
 
554 aa  1138    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  30.91 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0936  hypothetical protein  25.9 
 
 
479 aa  177  6e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.246203  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1899  hypothetical protein  27.44 
 
 
494 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0865  hypothetical protein  25.68 
 
 
510 aa  157  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0793  hypothetical protein  27.73 
 
 
519 aa  153  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.380387  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1048  hypothetical protein  25.59 
 
 
506 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0549773  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0650  hypothetical protein  25.64 
 
 
506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0724  hypothetical protein  25.82 
 
 
506 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  25.41 
 
 
490 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  26.71 
 
 
595 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  23.86 
 
 
602 aa  82  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  20.99 
 
 
575 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  25.55 
 
 
636 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  25.55 
 
 
636 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  25.55 
 
 
636 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  25.11 
 
 
636 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2159  hypothetical protein  23.35 
 
 
616 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.428916  normal  0.364676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  23.45 
 
 
616 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  23.35 
 
 
616 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2029  hypothetical protein  22.78 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2095  hypothetical protein  23.68 
 
 
617 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2092  hypothetical protein  23.01 
 
 
617 aa  64.7  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2107  hypothetical protein  24.87 
 
 
667 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>