16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0936 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0936  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  958    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.246203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0865  hypothetical protein  37.96 
 
 
510 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1899  hypothetical protein  36.65 
 
 
494 aa  280  3e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  36.79 
 
 
490 aa  252  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1048  hypothetical protein  31.09 
 
 
506 aa  192  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0549773  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0650  hypothetical protein  30.9 
 
 
506 aa  189  8e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0724  hypothetical protein  30.71 
 
 
506 aa  188  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314117  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0793  hypothetical protein  30.31 
 
 
519 aa  183  8.000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.380387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  25.9 
 
 
554 aa  177  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  26.16 
 
 
556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  23.43 
 
 
602 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  23.47 
 
 
575 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  23.58 
 
 
636 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  23.58 
 
 
636 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  22.76 
 
 
636 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  22.76 
 
 
636 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>