19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1904 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2095  hypothetical protein  54.11 
 
 		 617 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  56.95 
 
 		 595 aa  673    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1188    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  51.34 
 
 		 636 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  52.77 
 
 		 616 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  52.2 
 
 		 616 aa  621  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2092  hypothetical protein  52.83 
 
 		 617 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  50.55 
 
 		 636 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  51.82 
 
 		 636 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2159  hypothetical protein  51.71 
 
 		 616 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.428916  normal  0.364676 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  50.71 
 
 		 636 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2029  hypothetical protein  48.98 
 
 		 587 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2107  hypothetical protein  41.92 
 
 		 667 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  41.03 
 
 		 602 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  22.39 
 
 		 556 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  20.99 
 
 		 554 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0865  hypothetical protein  20.53 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0936  hypothetical protein  23.47 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.246203  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  27.45 
 
 		 490 aa  45.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>