17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2029 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2029  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1221    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  48.9 
 
 
575 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  47.17 
 
 
595 aa  568  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  46.25 
 
 
636 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  45.94 
 
 
636 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  45.78 
 
 
636 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  45.78 
 
 
636 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  45.34 
 
 
616 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2095  hypothetical protein  45.65 
 
 
617 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  44.59 
 
 
616 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2092  hypothetical protein  46.71 
 
 
617 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2159  hypothetical protein  44.18 
 
 
616 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.428916  normal  0.364676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2107  hypothetical protein  40.65 
 
 
667 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  38.31 
 
 
602 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  21.07 
 
 
556 aa  84.7  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  22.78 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0865  hypothetical protein  23.57 
 
 
510 aa  44.3  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>