18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1876 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2095  hypothetical protein  82.52 
 
 		 617 aa  1043    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  97.56 
 
 		 616 aa  1244    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2159  hypothetical protein  97.08 
 
 		 616 aa  1217    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.428916  normal  0.364676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1269    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  73.98 
 
 		 636 aa  970    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2092  hypothetical protein  73.72 
 
 		 617 aa  920    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  74.61 
 
 		 636 aa  974    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  73.82 
 
 		 636 aa  970    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  74.76 
 
 		 636 aa  979    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  52.77 
 
 		 575 aa  625  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  51.53 
 
 		 595 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2029  hypothetical protein  44.93 
 
 		 587 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2107  hypothetical protein  42.96 
 
 		 667 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  40.71 
 
 		 602 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  21.28 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  23.45 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  25.38 
 
 		 490 aa  44.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1899  hypothetical protein  26.28 
 
 		 494 aa  43.9  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>