18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1899 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1899  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  988    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  46.95 
 
 
490 aa  394  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0936  hypothetical protein  36.65 
 
 
479 aa  280  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.246203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0865  hypothetical protein  31.8 
 
 
510 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0724  hypothetical protein  30.74 
 
 
506 aa  194  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314117  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1048  hypothetical protein  31.2 
 
 
506 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0549773  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0650  hypothetical protein  29.66 
 
 
506 aa  187  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0793  hypothetical protein  30.28 
 
 
519 aa  166  9e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.380387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  27.44 
 
 
554 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  22.48 
 
 
556 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  19.68 
 
 
595 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  28.15 
 
 
636 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  26.67 
 
 
636 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  25.93 
 
 
636 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2159  hypothetical protein  26.28 
 
 
616 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.428916  normal  0.364676 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  25.93 
 
 
636 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  26.28 
 
 
616 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  26.28 
 
 
616 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>