22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0793 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0793  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1023    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.380387  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0650  hypothetical protein  49.21 
 
 
506 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1048  hypothetical protein  49.41 
 
 
506 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0549773  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0724  hypothetical protein  49.02 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314117  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0936  hypothetical protein  30.54 
 
 
479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.246203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0865  hypothetical protein  29.6 
 
 
510 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1899  hypothetical protein  30.28 
 
 
494 aa  173  6.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  32.06 
 
 
490 aa  172  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  27.73 
 
 
554 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  25.79 
 
 
556 aa  92  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  21.47 
 
 
602 aa  53.9  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  28.24 
 
 
575 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0414  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase, small subunit  25.79 
 
 
544 aa  47.4  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.791101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  24.41 
 
 
636 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  24.41 
 
 
636 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2095  hypothetical protein  22.99 
 
 
617 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  23.62 
 
 
636 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2029  hypothetical protein  27.69 
 
 
587 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  24.41 
 
 
616 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  22.83 
 
 
636 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  24.41 
 
 
616 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  25.88 
 
 
595 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>