17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2092 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2095  hypothetical protein  75.97 
 
 
617 aa  962    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1818  hypothetical protein  74.2 
 
 
616 aa  938    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2159  hypothetical protein  73.95 
 
 
616 aa  916    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.428916  normal  0.364676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1876  hypothetical protein  73.72 
 
 
616 aa  920    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1885  hypothetical protein  79.1 
 
 
636 aa  1015    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2092  hypothetical protein  100 
 
 
617 aa  1278    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1911  hypothetical protein  78.47 
 
 
636 aa  1013    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.604662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2408  hypothetical protein  78.63 
 
 
636 aa  1016    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353538  hitchhiker  0.000543183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1918  hypothetical protein  79.1 
 
 
636 aa  1019    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1904  hypothetical protein  52.83 
 
 
575 aa  631  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1761  hypothetical protein  50 
 
 
595 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2029  hypothetical protein  46.87 
 
 
587 aa  545  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2107  hypothetical protein  42.07 
 
 
667 aa  502  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1675  hypothetical protein  40.03 
 
 
602 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1432  hypothetical protein  22.13 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1102  hypothetical protein  23.35 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0097  hypothetical protein  25.38 
 
 
490 aa  45.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0106852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>