85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2648 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2078  methyltransferase type 12  88.89 
 
 		 493 aa  792    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0386809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2648  methyltransferase type 12  100 
 
 		 471 aa  926    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282799  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  40.71 
 
 		 1835 aa  260  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0629  Acyl transferase  40.86 
 
 		 1560 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  42.23 
 
 		 1837 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  34.14 
 
 		 1862 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  38.27 
 
 		 1734 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  40.22 
 
 		 1845 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  29.83 
 
 		 1897 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  29.83 
 
 		 1888 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  31.87 
 
 		 1884 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  30.1 
 
 		 1824 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  27.82 
 
 		 1889 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  34.34 
 
 		 1894 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  30.48 
 
 		 1809 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  32.83 
 
 		 3275 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  34.46 
 
 		 2090 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  34.46 
 
 		 2023 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  34.67 
 
 		 2006 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  31.68 
 
 		 1825 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  34.12 
 
 		 2084 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  29.72 
 
 		 1809 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  31.56 
 
 		 1825 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  31.56 
 
 		 1825 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5922  beta-ketoacyl synthase  36.55 
 
 		 2021 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  26.77 
 
 		 2551 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  31.79 
 
 		 3173 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  30.65 
 
 		 3163 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1765  oxidoreductase domain protein  21.97 
 
 		 723 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  34.16 
 
 		 2975 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  34.34 
 
 		 5778 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  34.34 
 
 		 4212 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  34.34 
 
 		 5915 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  34.34 
 
 		 5822 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  34.34 
 
 		 5993 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  32.89 
 
 		 4048 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  37.21 
 
 		 4649 aa  97.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  32.61 
 
 		 5802 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  32.48 
 
 		 4122 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  34.96 
 
 		 4580 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  34.96 
 
 		 4098 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  34.96 
 
 		 4101 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  32.48 
 
 		 4123 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  32.48 
 
 		 4157 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  36.53 
 
 		 2880 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  33.53 
 
 		 1424 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  30.21 
 
 		 4165 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  31.64 
 
 		 2896 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  29.66 
 
 		 4429 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3035  beta-ketoacyl synthase  30.67 
 
 		 2257 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744051  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03612  polyketide synthase, putative (JCVI)  33.01 
 
 		 2472 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0673136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1810  polyketide synthase protein  35.5 
 
 		 2380 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362155  normal  0.526323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  33.53 
 
 		 5612 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  38.07 
 
 		 5628 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  32.47 
 
 		 7149 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08412  hybrid PKS-NRPS (Eurofung)  28.62 
 
 		 3930 aa  79.7  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  29.93 
 
 		 4268 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08383  polyketide synthase, putative (JCVI)  23.99 
 
 		 2476 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  27.94 
 
 		 2498 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03386  polyketide synthase, putative (JCVI)  30.11 
 
 		 2493 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  31.77 
 
 		 2082 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  30.91 
 
 		 2333 aa  73.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01784  polyketide synthase, putative (JCVI)  28.31 
 
 		 2510 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.184265 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  36.53 
 
 		 3818 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  36.53 
 
 		 5021 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  36.53 
 
 		 5023 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01034  polyketide synthase, putative (JCVI)  26.78 
 
 		 2793 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.276801 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01036  polyketide synthase, putative (JCVI)  36.67 
 
 		 2527 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.756203 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  36.53 
 
 		 4874 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06431  polyketide synthase, putative (JCVI)  33.73 
 
 		 2410 aa  70.9  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.572947  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02547  polyketide synthase, putative (Eurofung)  29.76 
 
 		 2534 aa  70.1  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4312  erythronolide synthase  30.06 
 
 		 2260 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.908395 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06448  polyketide synthase, putative (JCVI)  29.84 
 
 		 2517 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.576912  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02035  polyketide synthase, putative (JCVI)  31.58 
 
 		 2544 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47973 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  25.14 
 
 		 2035 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03273  PKS-like enzyme, putative (JCVI)  29.63 
 
 		 1730 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102445  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06791  polyketide synthase, putative (JCVI)  28.49 
 
 		 2568 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.489917  normal  0.163501 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08910  polyketide synthase, putative (JCVI)  33.63 
 
 		 2449 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09005  polyketide synthase, putative (JCVI)  34.21 
 
 		 2404 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.661686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  25.2 
 
 		 256 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 204 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 226 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 260 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 527 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  32.14 
 
 		 761 aa  43.1  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>