84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2078 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2648  methyltransferase type 12  88.89 
 
 
471 aa  729    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282799  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2078  methyltransferase type 12  100 
 
 
493 aa  971    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0386809  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  40.97 
 
 
1835 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0629  Acyl transferase  41.24 
 
 
1560 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  41.89 
 
 
1837 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  36.41 
 
 
1734 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  33.7 
 
 
1862 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  39.08 
 
 
1845 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  29.37 
 
 
1897 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  29.37 
 
 
1888 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  32.36 
 
 
1884 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  30.91 
 
 
1824 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  30.87 
 
 
1809 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  27.57 
 
 
1889 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  33.45 
 
 
1894 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  32.35 
 
 
3275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  29.85 
 
 
1809 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  31.06 
 
 
2006 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  33.78 
 
 
2090 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  33.45 
 
 
2084 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  33.78 
 
 
2023 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  31.55 
 
 
1825 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  30.73 
 
 
1825 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  30.73 
 
 
1825 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  30.27 
 
 
3173 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5922  beta-ketoacyl synthase  37.61 
 
 
2021 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  26.63 
 
 
2551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  34.16 
 
 
2975 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  28 
 
 
3163 aa  111  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1765  oxidoreductase domain protein  22.05 
 
 
723 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  32.97 
 
 
4048 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  34.26 
 
 
4212 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  34.26 
 
 
5778 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  34.26 
 
 
5822 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  33.58 
 
 
5915 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  33.58 
 
 
5993 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  30.5 
 
 
4165 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  33.33 
 
 
4122 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  37.04 
 
 
4580 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  37.04 
 
 
4098 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  37.04 
 
 
4101 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  38.95 
 
 
4649 aa  98.2  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  35.19 
 
 
2880 aa  97.1  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  33.33 
 
 
4123 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  33.33 
 
 
4157 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  23.96 
 
 
1424 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  27.68 
 
 
5802 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  31.91 
 
 
2896 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1810  polyketide synthase protein  35.88 
 
 
2380 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362155  normal  0.526323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3035  beta-ketoacyl synthase  31.71 
 
 
2257 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744051  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  28.46 
 
 
4429 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  32.63 
 
 
7149 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  37.36 
 
 
5628 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03612  polyketide synthase, putative (JCVI)  32.62 
 
 
2472 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0673136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  31.4 
 
 
5612 aa  83.6  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08412  hybrid PKS-NRPS (Eurofung)  31.21 
 
 
3930 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  32.3 
 
 
2333 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  28.78 
 
 
4268 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08383  polyketide synthase, putative (JCVI)  24.45 
 
 
2476 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  29.2 
 
 
2498 aa  77  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01036  polyketide synthase, putative (JCVI)  36.67 
 
 
2527 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.756203 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  29.97 
 
 
2082 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02547  polyketide synthase, putative (Eurofung)  30.36 
 
 
2534 aa  73.6  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06431  polyketide synthase, putative (JCVI)  31.58 
 
 
2410 aa  73.2  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.572947  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01784  polyketide synthase, putative (JCVI)  28.98 
 
 
2510 aa  71.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.184265 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03386  polyketide synthase, putative (JCVI)  29.51 
 
 
2493 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01034  polyketide synthase, putative (JCVI)  25.86 
 
 
2793 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.276801 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  35.12 
 
 
4874 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  35.12 
 
 
5021 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  35.12 
 
 
5023 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  35.12 
 
 
3818 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06448  polyketide synthase, putative (JCVI)  31.22 
 
 
2517 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.576912  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02035  polyketide synthase, putative (JCVI)  31.58 
 
 
2544 aa  67.4  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4312  erythronolide synthase  27.91 
 
 
2260 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.908395 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06791  polyketide synthase, putative (JCVI)  26.07 
 
 
2568 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.489917  normal  0.163501 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03273  PKS-like enzyme, putative (JCVI)  26.96 
 
 
1730 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102445  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  25.56 
 
 
2035 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08910  polyketide synthase, putative (JCVI)  33.63 
 
 
2449 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09005  polyketide synthase, putative (JCVI)  34.21 
 
 
2404 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.661686  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
204 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  22.26 
 
 
344 aa  47.4  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  24.22 
 
 
256 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  23.02 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  26.59 
 
 
260 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>