106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1178 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1178  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2900  GCN5-related N-acetyltransferase  56.9 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  53.45 
 
 		 180 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2029  GCN5-related N-acetyltransferase  53.57 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4494  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  38.33 
 
 		 188 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  51.06 
 
 		 184 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.235365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 		 206 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  43.1 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.1 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  47.17 
 
 		 198 aa  50.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459408  hitchhiker  0.00554726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01610  ribosomal protein alanine acetyltransferase  44.44 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0630  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 		 219 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13110  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  41.82 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.615061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30550  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  43.64 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.926933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8645  GCN5-related N-acetyltransferase  46.3 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0633  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2859  acetyltransferase, GNAT family  35.71 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464219 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16420  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  40.35 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0118395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32650  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  43.64 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0377  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  43.64 
 
 		 221 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4083  GCN5-related N-acetyltransferase  41.82 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.893032  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1195  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.89265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 		 206 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000395052 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2358  acetyltransferase  35.71 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2534  acetyltransferase  35.71 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3284  acetyltransferase, GNAT family  35.71 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1789  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 		 198 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.750296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  47.06 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2474  acetyltransferase, GNAT family  35.71 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2812  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  45.1 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 		 194 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4288  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 		 286 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2863  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3339  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4374  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.171908  normal  0.472025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2487  GCN5-related N-acetyltransferase  47.17 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.839028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0978  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  45.1 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  45.1 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0170  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 		 212 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0838  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0220221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211341  normal  0.620155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5037  acetyltransferase, including N-acetylases of ribosomal protein  38.6 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4666  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 		 217 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868748  normal  0.839586 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0088  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4372  GCN5-related N-acetyltransferase  52.94 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1833  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.74 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3526  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 212 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4320  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.67 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8709  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00819117  normal  0.126537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0906  GCN5-related protein N-acetyltransferase  43.14 
 
 		 197 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4036  GCN5-related N-acetyltransferase  41.82 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1148  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10910  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  51.35 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0841  putative ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  41.18 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  35.19 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2283  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 		 343 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0732  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 		 195 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.820091  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39580  ribosomal protein alanine acetyltransferase  38.89 
 
 		 189 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0679  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 195 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35.71 
 
 		 380 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18400  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  47.92 
 
 		 192 aa  41.6  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 210 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0562469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11013  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimJ  40.74 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0249045  normal  0.821297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0706618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0892137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.720743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8007  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4642  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 225 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3809  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>