More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_30550  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  100 
 
 
227 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.926933  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0838  GCN5-related N-acetyltransferase  62.15 
 
 
200 aa  251  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0220221  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2812  GCN5-related N-acetyltransferase  62.15 
 
 
204 aa  234  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0906  GCN5-related protein N-acetyltransferase  56.42 
 
 
197 aa  227  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4451  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  54.72 
 
 
200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113986  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1967  GCN5-related N-acetyltransferase  52.48 
 
 
204 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2863  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 
205 aa  201  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16420  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  54.34 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0118395  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  48.88 
 
 
206 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000395052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0170  GCN5-related N-acetyltransferase  48.83 
 
 
212 aa  191  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  49.07 
 
 
207 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0377  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  47.2 
 
 
221 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8709  GCN5-related N-acetyltransferase  49.12 
 
 
225 aa  181  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00819117  normal  0.126537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4036  GCN5-related N-acetyltransferase  45.62 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357695  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
210 aa  178  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0892137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8645  GCN5-related N-acetyltransferase  48.18 
 
 
217 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  46.98 
 
 
220 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4083  GCN5-related N-acetyltransferase  44.86 
 
 
240 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.893032  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0794  GCN5-related N-acetyltransferase  49.44 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6319  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
206 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640498  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13110  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  44.71 
 
 
208 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.615061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  44.29 
 
 
215 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.720743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0747  GCN5-related N-acetyltransferase  42.99 
 
 
215 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215795  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32650  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  44.39 
 
 
215 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375064  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
218 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0630  GCN5-related N-acetyltransferase  42.33 
 
 
219 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0886  GCN5-related N-acetyltransferase  41 
 
 
206 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4666  GCN5-related N-acetyltransferase  40.1 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868748  normal  0.839586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  40.58 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4831  GCN5-related N-acetyltransferase  40.1 
 
 
221 aa  138  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340541  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4288  GCN5-related N-acetyltransferase  40.31 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  41.83 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4374  GCN5-related N-acetyltransferase  40.31 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.171908  normal  0.472025 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1675  acetyltransferase  36.02 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4642  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23870  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  40.48 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11013  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimJ  37.68 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0249045  normal  0.821297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4494  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
192 aa  104  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  33.51 
 
 
193 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  35.36 
 
 
198 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0633  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
204 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  38.14 
 
 
195 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  37.63 
 
 
195 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  34.21 
 
 
204 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  35.75 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  34.54 
 
 
195 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0841  putative ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.03 
 
 
195 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
195 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  33.51 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.22 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  31.22 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
194 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.88 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0679  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231722  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1789  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
182 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  32.16 
 
 
194 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.750296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  32.8 
 
 
202 aa  89.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5433  GCN5-related N-acetyltransferase  37.31 
 
 
179 aa  88.2  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988507  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
196 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211341  normal  0.620155 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  43.33 
 
 
173 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113437  decreased coverage  0.00454433 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  29.28 
 
 
184 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1148  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
194 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4320  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.91 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0066  acetyltransferase  29.67 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0069  acetyltransferase  28.57 
 
 
312 aa  85.9  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.46 
 
 
181 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
202 aa  85.5  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.235365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3047  GCN5-related N-acetyltransferase  44.23 
 
 
178 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0386186  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  42.48 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.444768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1195  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.89265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8007  GCN5-related N-acetyltransferase  33.15 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  33.15 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal  0.20084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  39.42 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.482966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3526  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140052  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3314  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.43 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1833  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.65 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
192 aa  79  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459408  hitchhiker  0.00554726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01062  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  29.51 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2580  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.873673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2260  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  29.51 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2534  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  29.51 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.680812  normal  0.11611 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01070  hypothetical protein  29.51 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  29.51 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  29.51 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2063  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  29.51 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1445  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  29.51 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.197686  hitchhiker  0.00299094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1239  acetyltransferase  41.94 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5745  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3809  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20327  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4559  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1580  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  29.35 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1279  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  30.05 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1264  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  30.05 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1235  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  30.05 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0954445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>