95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2379 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2379  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1430    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0467507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2007  sulfatase  46.36 
 
 		 682 aa  618  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21816  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2806  hypothetical protein  30.94 
 
 		 665 aa  233  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2675  hypothetical protein  31.06 
 
 		 665 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  23.94 
 
 		 1065 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  21.51 
 
 		 1041 aa  74.3  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  23.06 
 
 		 491 aa  66.6  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  24.43 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  22.89 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  24.18 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  24.18 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  24.18 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  24.18 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  22.82 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  23.16 
 
 		 495 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  24.76 
 
 		 513 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  21.34 
 
 		 486 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  21.04 
 
 		 457 aa  55.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1765  sulfatase  23.88 
 
 		 395 aa  54.7  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  22.94 
 
 		 473 aa  54.3  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  24.25 
 
 		 429 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  21.05 
 
 		 450 aa  53.5  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  24.84 
 
 		 511 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  21.71 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  23 
 
 		 511 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  22.57 
 
 		 486 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  21.4 
 
 		 642 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  25.48 
 
 		 511 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  23.94 
 
 		 482 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  22.93 
 
 		 502 aa  52.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  23.49 
 
 		 486 aa  52.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  24.84 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  23.91 
 
 		 447 aa  52  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  24.18 
 
 		 449 aa  52  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.45 
 
 		 501 aa  51.6  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  21.96 
 
 		 629 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3592  sulfatase  20.34 
 
 		 451 aa  51.2  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  20.05 
 
 		 642 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0533  sulfatase  19.61 
 
 		 486 aa  50.8  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.270273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  21.4 
 
 		 642 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  22.15 
 
 		 642 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  21.17 
 
 		 642 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  21.92 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  21.92 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  21.17 
 
 		 642 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  21.92 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  21.92 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  23.42 
 
 		 505 aa  50.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  28.83 
 
 		 497 aa  50.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  24.69 
 
 		 509 aa  50.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1626  sulfatase  21.65 
 
 		 476 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.773199  normal  0.470838 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  20.49 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  23.02 
 
 		 484 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  23.51 
 
 		 466 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  24.19 
 
 		 516 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  24.19 
 
 		 516 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  24.19 
 
 		 516 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  22.57 
 
 		 551 aa  48.5  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  22.73 
 
 		 537 aa  48.5  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  22.54 
 
 		 622 aa  47.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2755  sulfatase  22.22 
 
 		 473 aa  47.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.8787  normal  0.694021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  36.67 
 
 		 518 aa  47.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  30.21 
 
 		 508 aa  48.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4646  sulfatase  23.51 
 
 		 461 aa  47.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0575  sulfatase family protein  24.71 
 
 		 608 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  22.29 
 
 		 495 aa  47.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1478  sulfatase  26.19 
 
 		 558 aa  47  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  22.29 
 
 		 495 aa  47.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  29.01 
 
 		 517 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  27.66 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  27.66 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  27.66 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3519  sulfatase  32.39 
 
 		 545 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  22.11 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  27.66 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0538  sulfatase  22.17 
 
 		 451 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  29.01 
 
 		 517 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  27.66 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1102  sulfatase  21.67 
 
 		 506 aa  46.6  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0852605  normal  0.561012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  22.48 
 
 		 486 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  32.67 
 
 		 586 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  25 
 
 		 442 aa  45.8  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  22.71 
 
 		 470 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2686  twin-arginine translocation pathway signal  21.27 
 
 		 490 aa  45.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  23.57 
 
 		 517 aa  45.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  21.53 
 
 		 489 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  28.07 
 
 		 587 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  23.83 
 
 		 452 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  21.15 
 
 		 641 aa  44.3  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1066  sulfatase  18.98 
 
 		 451 aa  44.3  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.884442 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  23.19 
 
 		 639 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  25.15 
 
 		 638 aa  44.3  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  36 
 
 		 466 aa  43.9  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  25.15 
 
 		 647 aa  43.9  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  31.58 
 
 		 559 aa  43.9  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>