51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2806 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2806  hypothetical protein  100 
 
 
665 aa  1350    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2675  hypothetical protein  97.44 
 
 
665 aa  1296    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2379  hypothetical protein  30.87 
 
 
691 aa  239  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0467507  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2007  sulfatase  29.05 
 
 
682 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21816  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  22.74 
 
 
1041 aa  67.8  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  24.21 
 
 
479 aa  58.9  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  20.83 
 
 
1065 aa  57.4  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0533  sulfatase  22.51 
 
 
486 aa  57.4  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.270273  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  26.07 
 
 
560 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  25.64 
 
 
539 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  25.64 
 
 
560 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  25.64 
 
 
560 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  25.64 
 
 
560 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  25.64 
 
 
560 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  24.88 
 
 
539 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  32.26 
 
 
438 aa  54.3  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  23.13 
 
 
429 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  21.64 
 
 
447 aa  53.5  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  23.5 
 
 
784 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  22.43 
 
 
627 aa  51.2  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  28.43 
 
 
462 aa  50.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1263  sulfatase  25.23 
 
 
534 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1378  sulfatase  25.23 
 
 
557 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3148  sulfatase  25.23 
 
 
534 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  30.43 
 
 
453 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  23.05 
 
 
457 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  21.71 
 
 
480 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3376  sulfatase  23.08 
 
 
509 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  24.55 
 
 
512 aa  48.5  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  22.63 
 
 
597 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  40.62 
 
 
424 aa  47.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  39.13 
 
 
596 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  39.13 
 
 
596 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  39.13 
 
 
596 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  26.14 
 
 
482 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1626  sulfatase  21 
 
 
476 aa  45.8  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.773199  normal  0.470838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1627  sulfatase  21.14 
 
 
657 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  20.59 
 
 
551 aa  45.8  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  24.09 
 
 
637 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  23.66 
 
 
512 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0154  sulfatase  24.29 
 
 
454 aa  45.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000668791 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  22.59 
 
 
514 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  28.33 
 
 
596 aa  45.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  24.84 
 
 
459 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  22.67 
 
 
548 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1033  sulfatase domain-containing protein  19.57 
 
 
662 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198685  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2825  sulfatase  21.03 
 
 
464 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424556  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  20.83 
 
 
497 aa  44.3  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08341  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02520)  27.57 
 
 
608 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333893  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  26.61 
 
 
543 aa  44.3  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.12 
 
 
489 aa  44.3  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>