91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2493 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  65.66 
 
 		 596 aa  862    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  65.66 
 
 		 592 aa  840    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  60.54 
 
 		 595 aa  772    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  65.66 
 
 		 595 aa  846    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  65.83 
 
 		 595 aa  848    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  62.81 
 
 		 594 aa  813    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  57.79 
 
 		 594 aa  716    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  65.49 
 
 		 596 aa  860    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  58.79 
 
 		 594 aa  764    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  100 
 
 		 596 aa  1238    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  65.66 
 
 		 596 aa  863    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  65.66 
 
 		 595 aa  847    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  67.38 
 
 		 604 aa  878    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  64.99 
 
 		 596 aa  849    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  65.66 
 
 		 595 aa  846    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  62.04 
 
 		 595 aa  795    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  33.5 
 
 		 601 aa  357  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  33.17 
 
 		 602 aa  349  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  32.94 
 
 		 600 aa  348  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  32.78 
 
 		 602 aa  343  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  31.86 
 
 		 595 aa  292  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  29.93 
 
 		 586 aa  286  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  29.77 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  29.93 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  29.77 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  29.77 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  29.16 
 
 		 586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  29.32 
 
 		 586 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  29.32 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  29.32 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  29.32 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  29.32 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  29.32 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  29.32 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  29.32 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  29.32 
 
 		 586 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  29.56 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  29.56 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  29.56 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  30.28 
 
 		 593 aa  270  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  27.82 
 
 		 580 aa  258  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  27.52 
 
 		 582 aa  258  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  29.36 
 
 		 590 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  28.85 
 
 		 590 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  27.27 
 
 		 582 aa  250  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  30.38 
 
 		 615 aa  230  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  25.58 
 
 		 617 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  25.58 
 
 		 617 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  25.41 
 
 		 622 aa  193  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  24.96 
 
 		 600 aa  183  6e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  26.16 
 
 		 613 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  25.12 
 
 		 637 aa  180  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  25.4 
 
 		 637 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  27.81 
 
 		 625 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  23.26 
 
 		 647 aa  167  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  23.44 
 
 		 611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  23.68 
 
 		 638 aa  166  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  31.29 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  25.68 
 
 		 607 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  26.17 
 
 		 609 aa  160  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  26.09 
 
 		 586 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  25.82 
 
 		 635 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  25.65 
 
 		 638 aa  153  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  21.76 
 
 		 607 aa  150  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  30.48 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  27.75 
 
 		 624 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  26.33 
 
 		 614 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  22.96 
 
 		 642 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  23.91 
 
 		 641 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  23.06 
 
 		 621 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  23.06 
 
 		 621 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  23.33 
 
 		 621 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  22.66 
 
 		 630 aa  70.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  30 
 
 		 513 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  22.22 
 
 		 429 aa  51.2  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  27.72 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  23.58 
 
 		 784 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  23.57 
 
 		 471 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  20.41 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  21.69 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  27.21 
 
 		 873 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  23.5 
 
 		 517 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2806  hypothetical protein  28.33 
 
 		 665 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  22.69 
 
 		 462 aa  44.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  22.95 
 
 		 522 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  22.95 
 
 		 522 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  28.7 
 
 		 517 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  22.95 
 
 		 517 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  22.95 
 
 		 522 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  22.95 
 
 		 522 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  22.95 
 
 		 522 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>