More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1765 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1765  sulfatase  100 
 
 
395 aa  801    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  27.38 
 
 
447 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  27.68 
 
 
784 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  29.18 
 
 
873 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  29.33 
 
 
457 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3376  sulfatase  25.39 
 
 
509 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0536  sulfatase  25.81 
 
 
473 aa  97.1  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  26.6 
 
 
1009 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  28.05 
 
 
429 aa  93.6  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  25.41 
 
 
450 aa  92.8  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  26.33 
 
 
490 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4030  sulfatase  28.28 
 
 
765 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868128  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.39 
 
 
501 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1436  sulfatase  26.16 
 
 
481 aa  90.1  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314748  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1597  sulfatase  27.21 
 
 
522 aa  89.7  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00665248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0154  sulfatase  24.6 
 
 
454 aa  87.8  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000668791 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0538  sulfatase  25.9 
 
 
451 aa  87.4  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  23.83 
 
 
474 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1626  sulfatase  27.93 
 
 
476 aa  87  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.773199  normal  0.470838 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3592  sulfatase  26.21 
 
 
451 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  24.77 
 
 
462 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  26.51 
 
 
637 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  25.32 
 
 
496 aa  84  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  26.84 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  24.29 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  25.49 
 
 
486 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  28.86 
 
 
1065 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  27.85 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0770  sulfatase  27.02 
 
 
486 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.119074  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0156  sulfatase  23.14 
 
 
374 aa  79  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000195612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  26.33 
 
 
630 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  25.82 
 
 
486 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  25.77 
 
 
497 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  27.04 
 
 
1041 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  24.71 
 
 
495 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  27.25 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2973  sulfatase  27.18 
 
 
480 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.08 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3519  sulfatase  27.7 
 
 
545 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1102  sulfatase  25.54 
 
 
506 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0852605  normal  0.561012 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  24.55 
 
 
537 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1201  sulfatase, putative  25.26 
 
 
507 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.68416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  25.45 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1363  sulfatase  26.21 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0156455  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  25.56 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1070  sulfatase  26.17 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  22.86 
 
 
535 aa  73.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  32.8 
 
 
498 aa  73.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1352  sulfatase  24.26 
 
 
548 aa  73.2  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.03 
 
 
479 aa  73.2  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1701  sulfatase  23.74 
 
 
483 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  23.42 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2553  sulfatase  23.19 
 
 
520 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  24.89 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  24.89 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  29.53 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  24.89 
 
 
497 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  24.89 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  25.66 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  24.94 
 
 
517 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  24.4 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  23.29 
 
 
489 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  24.31 
 
 
509 aa  70.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  25.42 
 
 
499 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  24.12 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0462  sulfatase, putative  24.64 
 
 
520 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  25.34 
 
 
474 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  25.8 
 
 
497 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  22.43 
 
 
500 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  24.41 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  25.24 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  24.89 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  23.06 
 
 
526 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  25.22 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  24.68 
 
 
494 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  23.01 
 
 
536 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  23.35 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  25.22 
 
 
515 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  23.71 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  25.63 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  22.63 
 
 
467 aa  67.4  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  26.71 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  25.97 
 
 
487 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0390  sulfatase  26.58 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0399  sulfatase  26.58 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0378  sulfatase  26.58 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0510065  normal  0.447114 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  28.46 
 
 
554 aa  66.6  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  25.54 
 
 
520 aa  66.6  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  23.18 
 
 
480 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  24.51 
 
 
513 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2007  sulfatase  22.99 
 
 
682 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21816  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  26.41 
 
 
497 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  24.94 
 
 
471 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1305  sulfatase  25.9 
 
 
491 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  22.98 
 
 
458 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  23.01 
 
 
564 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  24.77 
 
 
492 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  24.5 
 
 
510 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  24 
 
 
466 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  31.6 
 
 
503 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>