More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9350 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9350  amino-acid transporter transmembrane protein  100 
 
 		 510 aa  993    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.397172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3137  amino acid permease-associated region  55.14 
 
 		 663 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0382789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  48.71 
 
 		 489 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  47.36 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  48.33 
 
 		 495 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  46 
 
 		 492 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  44.14 
 
 		 516 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  41.2 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  44.04 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  42.52 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  41.74 
 
 		 512 aa  346  6e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4164  amino acid permease-associated region  45.59 
 
 		 537 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.696427  normal  0.49431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  43.47 
 
 		 499 aa  343  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  46.35 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  39.87 
 
 		 520 aa  339  7e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  43.06 
 
 		 485 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  42.39 
 
 		 521 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 		 515 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  45.11 
 
 		 491 aa  336  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  43.79 
 
 		 686 aa  335  9e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  40.4 
 
 		 515 aa  333  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  41.45 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  41.24 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  38.02 
 
 		 488 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  41.03 
 
 		 467 aa  329  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  41.03 
 
 		 467 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  41.79 
 
 		 476 aa  329  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  41.03 
 
 		 467 aa  329  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  41.03 
 
 		 467 aa  329  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  41.03 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  41.03 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  40.81 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  40.46 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  43.59 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  40.38 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 		 495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  43.19 
 
 		 495 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 		 504 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  43.13 
 
 		 501 aa  319  9e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  40.87 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  39.36 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1368  amino acid permease-associated region  43.38 
 
 		 490 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1332  amino acid permease-associated region  43.38 
 
 		 490 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1349  amino acid permease-associated region  43.38 
 
 		 490 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923637  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  39.39 
 
 		 471 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  39.39 
 
 		 471 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  39.18 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  39.18 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  39.18 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  39.18 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  39.45 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  39.18 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  39.18 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  38.48 
 
 		 495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  39.78 
 
 		 463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  38.22 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  36.06 
 
 		 490 aa  307  3e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  37.63 
 
 		 471 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  37.83 
 
 		 471 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  37.63 
 
 		 471 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  37.83 
 
 		 471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  39.43 
 
 		 468 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  38.96 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  38.74 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  39 
 
 		 497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  39.34 
 
 		 543 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 		 468 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  38.87 
 
 		 518 aa  303  6.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  40.3 
 
 		 468 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  40.3 
 
 		 468 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  37.88 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  39.39 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  37.35 
 
 		 494 aa  301  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  38.37 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  39.02 
 
 		 466 aa  301  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  36.44 
 
 		 471 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  36.44 
 
 		 471 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  36.44 
 
 		 471 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  38.72 
 
 		 469 aa  300  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  35.23 
 
 		 549 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  39.74 
 
 		 465 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  36.99 
 
 		 460 aa  297  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  38.82 
 
 		 466 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  38.51 
 
 		 465 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  38.15 
 
 		 495 aa  295  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  37.2 
 
 		 566 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  38.03 
 
 		 486 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  38.62 
 
 		 466 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  38.82 
 
 		 467 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  39.1 
 
 		 467 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  39.1 
 
 		 467 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  39.1 
 
 		 467 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  39.1 
 
 		 467 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  39.1 
 
 		 467 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  39.1 
 
 		 467 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  39.1 
 
 		 467 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  39.39 
 
 		 471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  35.8 
 
 		 496 aa  289  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>