84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4549 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  76.23 
 
 		 224 aa  346  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  74.66 
 
 		 223 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  70.72 
 
 		 225 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.09 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2051  hypothetical protein  52.99 
 
 		 146 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0320963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0499  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.69 
 
 		 142 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  37.4 
 
 		 154 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3506  hypothetical protein  35.82 
 
 		 135 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.71 
 
 		 147 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3695  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.71 
 
 		 147 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  35.71 
 
 		 147 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2259  hypothetical protein  36.57 
 
 		 190 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2134  hypothetical protein  35.57 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.26 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4254  hypothetical protein  36.57 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3379  hypothetical protein  34.33 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3638  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.59 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5621  hypothetical protein  34.25 
 
 		 151 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4069  hypothetical protein  37.23 
 
 		 153 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2951  hypothetical protein  35.61 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.56 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3292  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  40.46 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000330862  normal  0.034856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0952  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.88 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.59 
 
 		 155 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00315064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1183  hypothetical protein  34.81 
 
 		 147 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.56 
 
 		 139 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1111  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.56 
 
 		 139 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1083  hypothetical protein  35.56 
 
 		 139 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00152048  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  38.46 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10081  hypothetical protein  34.01 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.239804  normal  0.111783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09680  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.35 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313838  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4928  hypothetical protein  37.12 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.52831  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4105  hypothetical protein  31.34 
 
 		 135 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0929325  normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  33.83 
 
 		 146 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.09 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429345  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  32.56 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  32.56 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  32.56 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0993  putative DNA-binding protein  34.03 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2075  hypothetical protein  33.83 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000436269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0261  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.92 
 
 		 140 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00900094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0498  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  30.88 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1961  hypothetical protein  32.84 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3095  hypothetical protein  30.6 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.929414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0999  hypothetical protein  40.15 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  32.59 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2084  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.39 
 
 		 156 aa  62  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  31.39 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4835  hypothetical protein  31.85 
 
 		 155 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 105 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6100  hypothetical protein  34.56 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0683  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13150  hypothetical protein  34.04 
 
 		 110 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 76 aa  45.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3859  hypothetical protein  32.93 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  30.28 
 
 		 182 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3470  hypothetical protein  24.14 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.753379  normal  0.434423 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 128 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  32.08 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  28.15 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  46.15 
 
 		 368 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 90 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 428 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  37.66 
 
 		 132 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 84 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 428 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 117 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  29 
 
 		 181 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.2 
 
 		 203 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 151 aa  42  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>