57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0952 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0952  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  100 
 
 
140 aa  286  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1183  hypothetical protein  47.45 
 
 
147 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.26 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429345  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  45.45 
 
 
146 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1111  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.19 
 
 
139 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1083  hypothetical protein  45.19 
 
 
139 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00152048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.19 
 
 
139 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  44.7 
 
 
144 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5621  hypothetical protein  43.8 
 
 
151 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  43.18 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  44.36 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  44.36 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  44.36 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2134  hypothetical protein  52.46 
 
 
185 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  45.6 
 
 
174 aa  113  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  51.69 
 
 
155 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00315064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4069  hypothetical protein  46.15 
 
 
153 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  44.88 
 
 
154 aa  104  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3638  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.1 
 
 
154 aa  102  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  39.55 
 
 
144 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2075  hypothetical protein  39.34 
 
 
152 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000436269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  41.41 
 
 
135 aa  94.4  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0261  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.19 
 
 
140 aa  93.2  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00900094  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2084  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  50.81 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.2 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3379  hypothetical protein  42.5 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3292  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  39.2 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000330862  normal  0.034856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.29 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632085  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  37.29 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3695  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.29 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164379  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4928  hypothetical protein  35.94 
 
 
177 aa  80.5  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.52831  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3095  hypothetical protein  35.56 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.929414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  35.2 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3506  hypothetical protein  33.87 
 
 
135 aa  77  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.09 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  34.88 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  34.38 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  33.08 
 
 
225 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0499  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  38.33 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13150  hypothetical protein  41.05 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4254  hypothetical protein  35.54 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  31.78 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.58 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2951  hypothetical protein  32.52 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0993  putative DNA-binding protein  34.75 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09680  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.65 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313838  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0498  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  33.87 
 
 
201 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3470  hypothetical protein  30.08 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.753379  normal  0.434423 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.71 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4105  hypothetical protein  31.36 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0929325  normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2259  hypothetical protein  30.65 
 
 
190 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1820  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.3 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2051  hypothetical protein  28.69 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0320963  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10081  hypothetical protein  33.59 
 
 
152 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.239804  normal  0.111783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1961  hypothetical protein  33.04 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6269  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.53 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341844  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0864  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.11 
 
 
147 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>