58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4928 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4928  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  354  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.52831  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  52.45 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3292  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  47.48 
 
 
143 aa  127  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000330862  normal  0.034856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3638  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.7 
 
 
154 aa  95.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4254  hypothetical protein  42.64 
 
 
136 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2951  hypothetical protein  41.09 
 
 
145 aa  93.2  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4105  hypothetical protein  40.77 
 
 
135 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0929325  normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  37.9 
 
 
154 aa  87.8  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.32 
 
 
155 aa  84.3  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00315064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0499  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  38.64 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2134  hypothetical protein  40.17 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0952  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  35.94 
 
 
140 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3506  hypothetical protein  34.59 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1083  hypothetical protein  38.71 
 
 
139 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00152048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.71 
 
 
139 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1111  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.71 
 
 
139 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  37.4 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3695  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.4 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164379  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.4 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632085  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0498  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  37.4 
 
 
201 aa  77.4  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2259  hypothetical protein  40.88 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0261  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.12 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00900094  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.4 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  37.24 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.17 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  36.75 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  36.75 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5621  hypothetical protein  34.68 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.4 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429345  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  36.75 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  39.42 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1183  hypothetical protein  35.09 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  37.12 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  36.07 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  32.09 
 
 
225 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  36.13 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  35.78 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  31.08 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  34.53 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4069  hypothetical protein  37.36 
 
 
153 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  31.9 
 
 
135 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2051  hypothetical protein  36.43 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0320963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1961  hypothetical protein  36.7 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3095  hypothetical protein  33.59 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.929414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3379  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09680  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.97 
 
 
136 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313838  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.06 
 
 
154 aa  58.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3470  hypothetical protein  30.95 
 
 
147 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.753379  normal  0.434423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10081  hypothetical protein  34.92 
 
 
152 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.239804  normal  0.111783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4835  hypothetical protein  39.52 
 
 
155 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2075  hypothetical protein  29.32 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000436269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0993  putative DNA-binding protein  36.59 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13150  hypothetical protein  36.73 
 
 
110 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2084  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.33 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3548  hypothetical protein  30.94 
 
 
142 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6100  hypothetical protein  40.21 
 
 
134 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0999  hypothetical protein  33.61 
 
 
135 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.47 
 
 
142 aa  44.3  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>