145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4684 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  76.23 
 
 		 236 aa  332  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  66.07 
 
 		 225 aa  313  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  69.82 
 
 		 223 aa  311  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.82 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2051  hypothetical protein  48.48 
 
 		 146 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0320963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0499  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.15 
 
 		 142 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2134  hypothetical protein  39.13 
 
 		 185 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  37.69 
 
 		 154 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3506  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.78 
 
 		 154 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3379  hypothetical protein  33.82 
 
 		 153 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.33 
 
 		 155 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00315064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4069  hypothetical protein  34.97 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3638  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.85 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  33.81 
 
 		 147 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2259  hypothetical protein  34.09 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3695  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.81 
 
 		 147 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.81 
 
 		 147 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4254  hypothetical protein  32.58 
 
 		 136 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2951  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5621  hypothetical protein  34.03 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3292  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  36.23 
 
 		 143 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000330862  normal  0.034856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09680  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.09 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313838  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1083  hypothetical protein  34.59 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00152048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.59 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1111  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.59 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1183  hypothetical protein  35.07 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0952  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.38 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  35.61 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.85 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429345  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.37 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1961  hypothetical protein  33.58 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4105  hypothetical protein  29.85 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0929325  normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3095  hypothetical protein  30.3 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.929414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2075  hypothetical protein  31.65 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000436269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  32.58 
 
 		 146 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0261  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.11 
 
 		 140 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00900094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  30.23 
 
 		 135 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  30.23 
 
 		 135 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  30.23 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  33.09 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10081  hypothetical protein  31.58 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.239804  normal  0.111783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4928  hypothetical protein  31.08 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.52831  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0498  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  31.08 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  30.67 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0993  putative DNA-binding protein  30.66 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  31.88 
 
 		 144 aa  62  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2084  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.1 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0999  hypothetical protein  36.23 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6100  hypothetical protein  36.96 
 
 		 134 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  31.73 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  31.73 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  31.73 
 
 		 181 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 181 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  31.73 
 
 		 181 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  31.73 
 
 		 181 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  31.73 
 
 		 181 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  31.73 
 
 		 181 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  31.07 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 105 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4835  hypothetical protein  29.63 
 
 		 155 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  35.24 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 128 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8486  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  28.97 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3470  hypothetical protein  24.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.753379  normal  0.434423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 182 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.39 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 77 aa  45.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2025  aldehyde dehydrogenase-like protein  26.09 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  31.87 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 83 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  29 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 112 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  36.99 
 
 		 81 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 76 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  30.38 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 60 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 84 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>