53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0993 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0993  putative DNA-binding protein  100 
 
 
140 aa  279  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.17 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00315064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4254  hypothetical protein  36.43 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2951  hypothetical protein  35.71 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.33 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632085  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  34.33 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3695  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.33 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164379  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  31.82 
 
 
225 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3095  hypothetical protein  35.71 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.929414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0498  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  32.58 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3638  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.52 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  37.59 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  31.88 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.31 
 
 
225 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  34.03 
 
 
236 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.1 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4069  hypothetical protein  34.13 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3292  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  32.84 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000330862  normal  0.034856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0499  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  34.85 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2134  hypothetical protein  32.14 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0999  hypothetical protein  36.51 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2075  hypothetical protein  33.59 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000436269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3506  hypothetical protein  35.71 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2259  hypothetical protein  35.25 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  30.66 
 
 
224 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  30.88 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  32.54 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  32.54 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  32.54 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0952  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.75 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3379  hypothetical protein  31.54 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1083  hypothetical protein  33.59 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00152048  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1111  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.59 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.59 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4105  hypothetical protein  31.75 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0929325  normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4928  hypothetical protein  36.59 
 
 
177 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.52831  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  28.57 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2051  hypothetical protein  32.33 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0320963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4835  hypothetical protein  34.06 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2084  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.81 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1183  hypothetical protein  29.41 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09680  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.71 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313838  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  30.89 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  41.56 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  28.35 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5621  hypothetical protein  29.27 
 
 
151 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.46 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429345  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  27.64 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.55 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3470  hypothetical protein  30.25 
 
 
147 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.753379  normal  0.434423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  29.31 
 
 
144 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10081  hypothetical protein  32.39 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.239804  normal  0.111783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0261  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.37 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00900094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>