61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4094 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  775    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  69.6 
 
 
378 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  56.77 
 
 
383 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  36.88 
 
 
393 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  35.16 
 
 
362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  33.14 
 
 
370 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  33.06 
 
 
368 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  31.45 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  26.98 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  26.95 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  28.14 
 
 
397 aa  92.8  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  27.38 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  24.8 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  32.25 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  30.13 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  27.61 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  34.88 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  24.44 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  27.7 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  28.12 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  29.28 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  30.09 
 
 
353 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  26.2 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  28.64 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  23.48 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  26.44 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  26.42 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  27.19 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  21.69 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  20.74 
 
 
357 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  29.48 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  26.55 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  29.07 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  27.51 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  24.79 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0129  hypothetical protein  36.11 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  26.2 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  26.7 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  24.6 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  26.98 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  28.95 
 
 
392 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  27.81 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3558  hypothetical protein  29.36 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  26.17 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  28.43 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  31.1 
 
 
355 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1533  hypothetical protein  34.15 
 
 
393 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  25.86 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  24.87 
 
 
355 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  25.93 
 
 
365 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  20.62 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  24.93 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  29.08 
 
 
374 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  32.14 
 
 
379 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  25.64 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  27.82 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  26.82 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  25.23 
 
 
355 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  25.23 
 
 
355 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4213  hypothetical protein  29.28 
 
 
397 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  31.52 
 
 
374 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>