14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1533 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1533  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  754    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0129  hypothetical protein  56.95 
 
 
364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  52.86 
 
 
363 aa  324  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3359  hypothetical protein  36.89 
 
 
374 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157924  normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  39.17 
 
 
385 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  31.01 
 
 
397 aa  90.1  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  26.18 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3558  hypothetical protein  28.38 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  31.25 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  26.35 
 
 
392 aa  57  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  34.15 
 
 
389 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  31.1 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  39.23 
 
 
368 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  35.2 
 
 
370 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>