49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3538 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  801    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  55.28 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  34.61 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  30.08 
 
 		 392 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3558  hypothetical protein  33.01 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  33.24 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  29.25 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  28.54 
 
 		 370 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0129  hypothetical protein  27.37 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3359  hypothetical protein  27.59 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157924  normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  27.61 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  28.7 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  26.67 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1533  hypothetical protein  26.18 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  28.85 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  26.46 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  23.21 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  32.96 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  29.49 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  26.95 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  23.79 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  26.69 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  31.19 
 
 		 353 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4213  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  27.52 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  21.64 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  24.1 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  26.39 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  24.2 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  25.61 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  27.64 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  24.36 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  27.67 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  24.2 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  25.07 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  24.17 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  26.5 
 
 		 367 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  25.81 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  26.82 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  22.44 
 
 		 357 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  25.8 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  27.96 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  30.86 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  25.47 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  29.3 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  28.37 
 
 		 355 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  26.32 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  27.27 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>