46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4941 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  756    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  46.19 
 
 
387 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  45.53 
 
 
394 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  42.57 
 
 
355 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  42.57 
 
 
355 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  40.97 
 
 
412 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  42.89 
 
 
396 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  42.29 
 
 
355 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  41.37 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  40.87 
 
 
391 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4213  hypothetical protein  41.36 
 
 
397 aa  212  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  36.21 
 
 
391 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  28.93 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  24.56 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  27.3 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0629  hypothetical protein  25.32 
 
 
367 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  23.46 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  28.7 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  27.42 
 
 
379 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  20.1 
 
 
357 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  29.08 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  28.62 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  30.79 
 
 
371 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  26.58 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  27.95 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  33.33 
 
 
375 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  26.63 
 
 
389 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  26.42 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  25.13 
 
 
355 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  24.6 
 
 
373 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  30.13 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  36.52 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  26.13 
 
 
378 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  23.33 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3484  hypothetical protein  29.11 
 
 
422 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  30.3 
 
 
374 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  26.8 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  29.66 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  30.3 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  23.65 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  32.35 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  26.25 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  29.41 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  30 
 
 
373 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  25 
 
 
365 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  29.88 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>