53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6445 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  37.19 
 
 
367 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  32.89 
 
 
378 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  33.42 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  30.79 
 
 
395 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  34.03 
 
 
342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  31.83 
 
 
353 aa  120  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  24.52 
 
 
357 aa  106  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  26.2 
 
 
352 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  32.05 
 
 
365 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  28.85 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  27.97 
 
 
366 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  28.72 
 
 
367 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  25.06 
 
 
357 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  30.48 
 
 
395 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  28.68 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02110  hypothetical protein  30.6 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.447654  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  27.82 
 
 
369 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  26.82 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  27.67 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  27.45 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  35.65 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  28.64 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  28.71 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  29.25 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  28.97 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  27.55 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  26.79 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  28.65 
 
 
370 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  27.89 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  28.82 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  24.37 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  26.87 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  27.4 
 
 
375 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  26.7 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  31.32 
 
 
362 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  25.61 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5047  hypothetical protein  26.68 
 
 
374 aa  60.1  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  29.47 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  27.89 
 
 
368 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  27.73 
 
 
373 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  23.82 
 
 
372 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  28.88 
 
 
383 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  39.08 
 
 
355 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  25.81 
 
 
404 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1410  hypothetical protein  33.04 
 
 
352 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  32.27 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  20.76 
 
 
367 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5325  hypothetical protein  30.36 
 
 
365 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  25.39 
 
 
368 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  25.29 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2866  dihydroxy-acid dehydratase  32 
 
 
613 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  37.5 
 
 
366 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>