46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2788 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  728    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  36.62 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  35.28 
 
 		 378 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  33.06 
 
 		 395 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  33.93 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02110  hypothetical protein  29.79 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.447654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  27 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  25.14 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  29.44 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5047  hypothetical protein  31.89 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  28.61 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  28.05 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  30.66 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  27.82 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  21.39 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  27.47 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  29.23 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  29.41 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  24.93 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  26.53 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  25.85 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  26.35 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  26.19 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  25.11 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  27.27 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  26.38 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  26.9 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1410  hypothetical protein  27.93 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  26.85 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  29.73 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  25.55 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  25.76 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  23.91 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  23.89 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  29.03 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  29.21 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  25.36 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  23.72 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  24.64 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  27.52 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  23.08 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  25 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0574  Hemagluttinin repeat-containing protein  30.16 
 
 		 7238 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  23.12 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>