26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1142 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  787    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  58.31 
 
 
393 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  32.39 
 
 
398 aa  186  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  31.65 
 
 
397 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  29.27 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0129  hypothetical protein  32.1 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  31.64 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  26.7 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  28.53 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3558  hypothetical protein  29.22 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1533  hypothetical protein  27.34 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  27.59 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3359  hypothetical protein  32.28 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157924  normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  25.93 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  27.57 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  29.89 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  30.82 
 
 
373 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  21.78 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  25.64 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  26.79 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  23.24 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  25.47 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  24.09 
 
 
383 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  30.25 
 
 
367 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  30.41 
 
 
342 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  27.59 
 
 
353 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>