29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3558 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3558  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  738    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  36.08 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  33.01 
 
 
398 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  33.75 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  26.95 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0129  hypothetical protein  36.51 
 
 
364 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  27.84 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1533  hypothetical protein  28.91 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  29.82 
 
 
389 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  29.08 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  31.62 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  31.35 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  28.75 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  30.08 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  32.94 
 
 
393 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  39.31 
 
 
353 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  24.72 
 
 
352 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  30.83 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3359  hypothetical protein  28.68 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157924  normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  28.68 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  21.01 
 
 
357 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  29.41 
 
 
353 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  29.44 
 
 
395 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  23.25 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  31.37 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  30.27 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  32.2 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  32.64 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  32.02 
 
 
342 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>