43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4016 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  762    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  34.61 
 
 
398 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  34.81 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3558  hypothetical protein  34.35 
 
 
390 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1533  hypothetical protein  37.96 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0129  hypothetical protein  33.24 
 
 
364 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  30.99 
 
 
363 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  26.63 
 
 
393 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  29.9 
 
 
392 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  30.85 
 
 
393 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3671  hypothetical protein  90.57 
 
 
56 aa  92.8  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  29.68 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3359  hypothetical protein  29.97 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157924  normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  29.74 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  26.2 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  28.11 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  27.17 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  33.12 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  26.39 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  27.79 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  27.27 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  23.39 
 
 
372 aa  60.1  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  18.16 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  28.63 
 
 
353 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  26.83 
 
 
395 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  25.47 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  27.46 
 
 
404 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  28.18 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  28.57 
 
 
367 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  30.81 
 
 
391 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  34.34 
 
 
367 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  33.13 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  32.89 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  25.67 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  27.17 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  24.86 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  25.26 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  28.96 
 
 
342 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  29.6 
 
 
366 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  26.88 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  26.52 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  25.34 
 
 
371 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3484  hypothetical protein  29.63 
 
 
422 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>