57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5273 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  732    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  40.51 
 
 		 352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  36.44 
 
 		 357 aa  259  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  33.77 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  31.25 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  31.53 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  28.73 
 
 		 395 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  29.6 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5047  hypothetical protein  29.49 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1410  hypothetical protein  30.88 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246412  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  27 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  30.68 
 
 		 342 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  25.07 
 
 		 367 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02110  hypothetical protein  26.07 
 
 		 384 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.447654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  25.06 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  24.44 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  26.73 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  25.15 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  28.89 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  28.06 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  25.74 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  24.43 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  24.59 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  28.39 
 
 		 367 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  25.61 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  21.78 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  24.07 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  24.1 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  26.79 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  29.07 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  23.7 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  23.77 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  23.1 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  28.22 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3484  hypothetical protein  31.58 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  23.98 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  25.48 
 
 		 383 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  30.28 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  26.06 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  26.63 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5325  hypothetical protein  24.93 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  23.24 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  21.92 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  26.22 
 
 		 404 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  25.89 
 
 		 412 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  26.38 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  21.52 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  23.16 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  22.33 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  22.29 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  27.78 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  22.48 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  25.67 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  24.16 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0629  hypothetical protein  23.95 
 
 		 367 aa  46.6  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  24.2 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  21.99 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>