33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1325 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  769    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  33.6 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  33.77 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5047  hypothetical protein  42.15 
 
 
374 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  26.67 
 
 
357 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  32.46 
 
 
353 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  30.91 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  31.66 
 
 
367 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  28.85 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  28.09 
 
 
378 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  29.03 
 
 
353 aa  87  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  27.79 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  34.21 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1410  hypothetical protein  32.5 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  30.86 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  28.92 
 
 
371 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  28.7 
 
 
366 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  30.13 
 
 
395 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  27.78 
 
 
365 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  26.54 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  25.5 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  26.11 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  29.26 
 
 
355 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  25.32 
 
 
367 aa  53.5  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  28.13 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  27.58 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02110  hypothetical protein  27.3 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.447654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  25.68 
 
 
372 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  28.03 
 
 
355 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  30.34 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  26.18 
 
 
377 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  27.01 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  26.7 
 
 
368 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.357323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>