54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3488 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  70.17 
 
 		 366 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  52.37 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  44.83 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  44.57 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  45.53 
 
 		 365 aa  242  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  46.15 
 
 		 375 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  39.67 
 
 		 372 aa  225  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5325  hypothetical protein  43.02 
 
 		 365 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  44.79 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  44.78 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  40.06 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  38.4 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3484  hypothetical protein  36.61 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  42.9 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  37.85 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  38.74 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  38.78 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  39.06 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  37.5 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  38.78 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  36.93 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  38.39 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  34.42 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  33.43 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  37.43 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  35.51 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  31.28 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  28.77 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  30.88 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  27.37 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  32.89 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  31.69 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  21.25 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  27.68 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  28.62 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  20.06 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  27.63 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  23.18 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  30.63 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  28.53 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  30.8 
 
 		 383 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  34.04 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  28.87 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  28.87 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  28.87 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  28.37 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  31.03 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  24.78 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  29.39 
 
 		 396 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  35.1 
 
 		 385 aa  53.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  27.67 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  26.3 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  27.76 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>