45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7108 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  756    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  46.19 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  43.75 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  44.42 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  43.94 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  43.94 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  43.38 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  40.98 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  42.39 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  39.53 
 
 		 412 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  37.98 
 
 		 391 aa  205  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4213  hypothetical protein  38.55 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  29.04 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  20.99 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  28.49 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  29.07 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0629  hypothetical protein  24.16 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  28.27 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  29.8 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  26.87 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  26.36 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  27.6 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  29.7 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  26.3 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  29.85 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  25.07 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  35.25 
 
 		 367 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  27.71 
 
 		 353 aa  53.1  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  27.58 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  23.16 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  27.78 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  27.27 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  32.27 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  24.25 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  27.36 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  31.83 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  26.09 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  28.97 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  32.5 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  27.7 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  28.92 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  30.53 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  28.44 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  28.9 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  30.72 
 
 		 377 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>