17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0629 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0629  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  752    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  25.82 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  24.16 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  21.2 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  23.65 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  26.46 
 
 
394 aa  52.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  26.72 
 
 
378 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4213  hypothetical protein  24.41 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  21.7 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  25.96 
 
 
392 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  24.71 
 
 
391 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  23.95 
 
 
357 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  25.95 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  25.53 
 
 
355 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  25.17 
 
 
379 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  25.93 
 
 
377 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  20.81 
 
 
355 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>