28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4213 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4213  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  784    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  51.55 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  50.55 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  48.32 
 
 		 391 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  41.97 
 
 		 391 aa  265  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  45.74 
 
 		 355 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  45.45 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  45.81 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  45.45 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  43.77 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  38.66 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  41.47 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  30.06 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  28.07 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  31.58 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  26.95 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  28.57 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  31.88 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  30.97 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  25.08 
 
 		 367 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  26.06 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  27.3 
 
 		 397 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  25.46 
 
 		 375 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  24.03 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0629  hypothetical protein  26.92 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  18.01 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  24.84 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>