25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4021 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  811    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  58.31 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  33.33 
 
 
398 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  31.78 
 
 
397 aa  170  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  26.63 
 
 
385 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0129  hypothetical protein  30.86 
 
 
364 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3558  hypothetical protein  25.8 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  31.9 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  23.04 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  23.93 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  23.48 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1533  hypothetical protein  31.25 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  25.23 
 
 
373 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  25.51 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  24.11 
 
 
372 aa  63.2  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3359  hypothetical protein  23.46 
 
 
374 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157924  normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  28.16 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  21.88 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  22.29 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  21.84 
 
 
367 aa  49.7  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  22.19 
 
 
378 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  28.3 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  30.2 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  24.93 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  30.43 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>