16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0129 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0129  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  65.1 
 
 
363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1533  hypothetical protein  56.95 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3359  hypothetical protein  38.4 
 
 
374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157924  normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  32.97 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  29.29 
 
 
397 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3558  hypothetical protein  36.11 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  27.37 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  30.86 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  32.1 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  36.11 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  27.27 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  34.57 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  33.53 
 
 
355 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  32.22 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  28.94 
 
 
368 aa  46.2  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>