36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5228 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  743    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  57.22 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  59.67 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  36.09 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  31.18 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  32.75 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  26.24 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  26.99 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  29.04 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  30.54 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  21.86 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  29.56 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  22.49 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  26.59 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  26.08 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  27.22 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  32 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  26.27 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  26.96 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  28.85 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  28.07 
 
 		 412 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  19.89 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  30.27 
 
 		 353 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  31.25 
 
 		 382 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  25.22 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  25 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  30.72 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  22.26 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  34.47 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  27.59 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  27.11 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  29.38 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  28.49 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  28.98 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  28.89 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  26.01 
 
 		 394 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>