30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0190 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  87.53 
 
 		 391 aa  663    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  83.59 
 
 		 397 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  100 
 
 		 393 aa  786    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  71.05 
 
 		 412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  71.53 
 
 		 412 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  74.18 
 
 		 407 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  69 
 
 		 400 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  61.12 
 
 		 427 aa  505  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  41.28 
 
 		 396 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  42.13 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  39.59 
 
 		 395 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  36.5 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  33.1 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  40.21 
 
 		 204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  30.98 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  39.16 
 
 		 199 aa  123  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  30.05 
 
 		 457 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  27.18 
 
 		 368 aa  106  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  26.77 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  26.82 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  26.38 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  25.13 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  24.9 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  21.79 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  26.85 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1414  hypothetical protein  27.87 
 
 		 148 aa  49.7  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0132  hypothetical protein  24.1 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4896  hypothetical protein  21.97 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.815839 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1415  hypothetical protein  41.38 
 
 		 195 aa  43.5  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.36 
 
 		 1668 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>