29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1552 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  75.28 
 
 		 397 aa  274  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  72.73 
 
 		 396 aa  264  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  51.45 
 
 		 395 aa  188  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  51.18 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  47.16 
 
 		 396 aa  154  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  41.18 
 
 		 400 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  40.96 
 
 		 391 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  39.76 
 
 		 397 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  39.16 
 
 		 393 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  33.66 
 
 		 427 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  38.46 
 
 		 407 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  36.31 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  36.31 
 
 		 412 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  29.06 
 
 		 461 aa  85.1  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  31.87 
 
 		 449 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  32.74 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  30.14 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  31.49 
 
 		 364 aa  64.7  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  26.75 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  24.84 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  28 
 
 		 368 aa  52.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  24.68 
 
 		 332 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2058  hypothetical protein  22.42 
 
 		 567 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  23.39 
 
 		 362 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2057  hypothetical protein  21.82 
 
 		 528 aa  44.7  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0132  hypothetical protein  24.72 
 
 		 382 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0047  hypothetical protein  21.21 
 
 		 398 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.577583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  28.47 
 
 		 416 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.215933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>